Viện Công nghiệp thực phẩm đã được cấp Giấy chứng nhận hệ thống quản lý ATTP – phù hợp với các yêu cầu của tiêu chuẩn ISO 22000:2018: Phối trộn, đóng gói phụ gia thực phẩm dạng bột, sản xuất thực phẩm bao gói sẵn dạng bột, cốm, trà túi lọc, dạng lỏng và nguyên liệu thực phẩm dạng bột, dạng lỏng. Theo QĐ số 518/2023/QĐ-BQC ngày 24/10/2023 của Văn phòng chứng nhận chất lượng thuộc Liên hiệp các hội KH&KT Việt Nam.